十年前，发生了震撼世界的重大事件“第一次爱之夏”。兰顿失去了他的父亲阿德洛克，现在已经在边境城镇贝尔福雷斯特参加了塔州联盟军校。被称赞为英雄的已故父亲。什么都没有的单调日常。兰顿身边的一切都很闷。但在兰顿面前，世界上最古老的LFO尼尔瓦修突然出现。从驾驶舱出现的是优莱卡。兰顿和优莱卡的旅程将在哪里结束？

随着优莱卡创造的假想世界的崩坏，假想世界的人们来到了地球。10年过去了，他们与地球上的原住民在暗中发生冲突。优莱卡此时成为了国联独立师团的上级战斗员。为保护世界和平而战斗着。优莱卡接到任务，保护和自己拥有同样能力的少女爱丽丝。二人在一路躲避追杀的过程中，开始渐渐互相理解。优莱卡穷尽全身力量战斗，下定决心保护爱丽丝与这个世界！（本作为高度进化的第三部电影，以由于珊瑚岩崩坏而变成普通人的优莱卡为主角。在前作‘ANEMONE’的最终，两个世界融合的10年后，长大的优莱卡保护着与过去的自己有着相同能力的少女艾莉丝，为了守护世界而战。）

故事讲述在儿时的那一天。父亲留下阿尼莫奈前往战场，之后成为了不归人。悔恨之情深深存留在阿尼莫奈小小的胸膛中。过了7年，阿尼莫奈身处父亲逝去的战场——东京。作为实验部队阿西德所执行的作战关键，安妮莫奈不得不与人类的敌人“第7个Eureka=Eureka Seven”战斗。被Eureka Seven逼入绝境的人类，已经只能把希望寄托在阿尼莫奈身上了。于是，阿尼莫奈潜入Eureka Seven的内部——。

与前作女主角优莱卡一样拥有一头青色头发的男主角是一名13岁少年，名字叫做弗卡依 青，目前弗卡依的父亲行踪不明，而母亲也在10年前不知被谁带走了。现在正与诊疗所里的老医生托斯奥一同生活。而女主角阿拉塔 娜露同样也是13岁，是与弗卡依一同成长的青梅竹马，阿拉塔因为童年时的事故而使拥有“犹达”力量的眼睛觉醒。阿拉塔自少身体便虚弱，需要把酸素放入在手上的酸素吸入器，现与父亲、妹妹及祖母一同生活中。本作的舞台也设定在冲绳的磐户岛上，当时的磐户岛正进行着自治权回复运动，但在某一天，在岛上出现的“珊瑚岩”受到了外界的攻击，而为了保护磐户岛，男主角弗卡依与人型LFO(Light Finding Operation)相遇的故事就此展开了。

在一场人类的浩劫之中，兰顿的父亲牺牲了自己，拯救了地球，被称为英雄永久的记入了史册。失去父亲后，兰顿一直和身为机械工程师的祖父相依为命。日复一日的寻常生活让兰顿感到十分压抑，只有一件事情能够激起他的兴趣，那就是在青年之中十分流行的“滑空”运动。兰顿十分仰慕滑空天才霍兰德，一直希望能够加入他的组织“月光洲”。某日，一位名叫优莱卡的神秘女孩驾驶着一架故障的LOF从天而降落到了兰顿的家中，随后，军队赶到，似乎在对优莱卡进行追捕。兰顿凭借着自己的勇气和实力战胜了军队，并因此而获得了加入月光洲的机会，少年平凡的命运就此改变。

根据广东英德县“马口事件”编写，粤北美丽的群山，英德县的马口，驻扎着一支民警部队。有一天傍晚，附近一个造纸厂突然失火．民警们在队长马德林的率领下，立即赶赴失火现场。到了现场，他们毫不犹豫地冲人火海，分头灭火和搬运物资设备。大火眼看就要给扑灭了，正当民警们冒险抢救最后一桶柴油时，油桶因受热、膨胀而冒烟，共青团员苏满基想把油桶推到水沟去，却不想油桶突然爆炸，苏满基、马德林和一部分民警陷入烈焰之中。县委杨书记赶到现场，组织灭火救人并把伤员送往医院。全县人民在县委的号召下，紧急行动起来，人们争相涌向医院，争着为英雄献血，抢救英雄们的生命。省委、地委派来最好的医生协助治疗。但马德林、苏满基终因伤势过重牺牲了。县医院设备不足，伤员情况仍在恶化。有人提议将重伤员送往广州，有人担心伤员在路上会遇到意外。省委书记告诉大家：党中央和毛主席非常关心受伤的同志。

得过普立兹奖的美国诗人伊丽莎白碧许，曾被誉为20世纪最伟大的女诗人之一，本片即根据她的爱情故事与创作历程改编。为寻求灵感，伊丽莎白到里约探访旧识…

转基因技术自问世以来，面临两种境况：一方面，它能帮助农作物抵御病虫害，提高作物产量，帮助部分落后国家摆脱饥饿与贫困；另一方面，关于转基因食品是否安全的质疑一浪高过一浪，引发了夏威夷岛对这一技术的争论，并一度立法禁止其应用在农业种植当中。持不同立场的科学家也展开了激烈辩论，社会活动家和科学家也发起了一系列运动试图说服公众站在自己那一边。转基因食品对人体和环境有害的言论，一直没有充分的科学数据来支撑。面对地球人口不断增长的局面，人类和科技究竟应该何去何从？

故事乖张离奇，讲述在一个只有男孩和妇女的小岛上，男孩正在接受一种奇怪治疗，小男孩尼古拉斯的潜水打破了原有的平衡。